武漢大學和清華大學同為國家重點大學，在科學研究和教育教學方面各有千秋。
武漢大學是中國教育部直屬的副部級全國重點大學，國家首批“雙一流”、“985工程”、“211工程”、“2011計劃”重點建設高校。截至2015年9月，武漢大學共有5個一級學科被認定為國家重點學科，共覆蓋29個二級學科。2013年，在教育部學位與研究生教育發展中心學科評估中，武漢大學4個一級學科排名中國第一，總數排名中國第6位。
清華大學由中華人民共和國教育部直屬，中央直管副部級建制，位列“211工程”、“985工程”、“世界一流大學和一流學科”，被譽為“紅色工程師的搖籃”。截至2017年4月，清華大學共有一級學科國家重點學科21個，二級學科國家重點學科6個。截至2013年，59位清華學子當選為解放前的中央研究院院士，500多位校友當選為兩院院士。
