透明代理的意思是客戶端根本不需要知道有代理伺服器的存在，它改變你的報文，並會傳送真實IP，多用於路由器的NAT轉發中。注意，加密的透明代理則是屬於匿名代理，意思是不用設定使用代理了。
隨著防火牆技術的發展，安全性高、操作簡便、介面友好的防火牆逐漸成為市場熱點。在這種情況下，可以大大簡化防火牆設定、提高安全效能的透明模式和透明代理就成為衡量產品效能的重要指標。於是在推薦產品的過程中，很多廠商往往會介紹自己的產品實現了透明模式和透明代理。
透明代理的原理如下：假設A為內部網路客戶機，B為外部網路伺服器，C為防火牆。當A對B有連線請求時，TCP連線請求被防火牆擷取並加以監控。擷取後當發現連線需要使用代理伺服器時，A和C之間首先建立連線，然後防火牆建立相應的代理服務通道與目標B建立連線，由此通過代理伺服器建立A和目標地址B的資料傳輸途徑。
