中小板和主機板兩者之間的掛牌上市條件不同、交易制度不同、投資主體要求也有所不同、上市公司的市場佔有率不同。
中小板的流通盤在1個億左右以下，相對主機板市場而言較低，而且主機板市場對發行人的營業期限、股本大小、盈利水平等方面會比中小板的要求較高。中小板和主機板的上市條件，主機板要求更嚴格一些。
兩者在交易制度上來看，主機板市場集合競價採用封閉式集合競價方式，每天只有一次開盤集合競價。而中小板市場集合競價採用開放式集合競價方式，每天有兩次集合競價開盤和收盤的時間。
主機板上市企業多是市場佔有率較高、規模較大、穩定性較強、盈利情況較好的大型傳統優秀企業。而中小板上市企業是相對主機板規模較小、市場佔有率相對較低、穩定性相對較弱的成熟期上市企業。
