宅基地轉讓協議有效，但只能在本村村民之間對宅基地上的房屋進行過戶交易。滿足條件的雙方當事人共同攜帶有關證明檔案、材料向當地縣、市土地管理部門提出宅基地使用權變更登記申請即可。
法律依據：
《土地管理法》第六十二條
農村村民一戶只能擁有一處宅基地，其宅基地的面積不得超過省、自治區、直轄市規定的標準。農村村民住宅用地，由鄉鎮人民政府稽核批准；其中，涉及佔用農用地的，依照本法第四十四條的規定辦理審批手續。農村村民出賣、出租、贈與住宅後，再申請宅基地的，不予批准。國務院農業農村主管部門負責全國農村宅基地改革和管理有關工作。
