南京海底世界有200餘種，10000多尾海洋魚類，6只來自南極的帝企鵝，20餘隻溫帶企鵝，並有北極熊、北極狐、海豚海獅等海洋哺乳動物30餘隻。南京海底世界擁有180度亞克力透明玻璃構成的隧道，長74米，寬3米，高2.4米，儲水量4000多噸，其中生活著百餘種海洋魚類。
南京海底世界於2007年2月正式落成並對外開放了一座現代化的極地動物館，其中包括了北極熊館以及帝企鵝、北海獅、北極狼和北極狐等大量珍貴的極地動物。2010年2月1日，最新一期改造專案水母館也正式對外開放。新落成的水母館展出了大量珍貴的水母品種，無論從展出數量還是展出效果都是亞洲第一的水平，海月水母、澳洲斑點水母等共同為您呈現出夢幻的海底之旅。除此之外，南京海底世界同時推出了許多的特色服務，例如海底漫步，兒童與海豚嬉戲，水下婚禮等，並且您還可以和美人魚、海豚海獅拍照合影留戀，親手對海狗、海豹、北極熊等進行餵食。
