1、柯南、灰原及少年偵探隊成員步美、光彥、元太隨博士露營完畢，繞道參觀西多摩市新建於富士山前的第一雙塔摩天大樓，毛利小五郎應雙塔所有者、他的學妹常盤美緒之邀，攜小蘭、園子參加開幕典禮；
2、大木提前入住B塔被害，目暮警官調查發現他與美緒有不同尋常關係，不久原亦被殺害於家中，因為現場留有與日本畫畫師作畫時所用的乳缽相似的小酒杯碎片，柯南由小酒杯聯想到灰原曾效力的、以酒名為綽號的黑暗組織，並注意到第二起案件中碎片上未沾染血跡；
3、開幕酒會上，美緒向賓客展示如月最為寶貴的富士山畫作時被殺，死相正如橫亙在富士山正中的雙塔的縮影圖，地上一顆原本該呆在美緒脖子上的珍珠令柯南將目光轉向如月；
4、A樓美緒公司電腦檔案所在的樓層及地下配電室發生爆炸，逃亡時刻，柯南注意到正有一支槍瞄準園子；
5、最後，柯南駕車載著少年偵探團借爆炸的氣流飛到隔壁大樓的游泳池裡順利逃脫。
