南昌工程學院比較好的專業分別是水利水電工程、電氣工程及其自動化、土木工程、水土保持與荒漠化防治、機械電子工程、英語、電腦科學與技術、測繪工程、水文與水資源工程、電氣工程及其自動化。
南昌工程學院是一所由江西省人民政府與中華人民共和國水利部共建，以工學為主，文學、經濟學、理學、農學、管理學、藝術學等多學科協調發展的水利特色院校；南昌工程學院前身為創建於1958年的江西水利電力學院，此後歷經江西省水利水電學校大專部、江西工學院水利分院、江西水利專科學校、南昌水利水電專科學校、南昌水利水電高等專科學校，2004年升格為本科院校，更名為南昌工程學院。
