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第一,很明顯的可以向量化和矩陣化的loop,改變矩陣或者向量的大小,都是比較耗時的,這些可以在R內部通過矩陣化,正確估計矩陣的dim來解決。
第二,對於比較簡單的函式,基本程式本身寫好之後,用Rprof做profiling,找到最耗時間的環節,用inline和Rcpp包把最耗時間的部分重新寫一次。
第三,可以並行的計算做並行處理。
第四,使用ff包處理大的資料表格。
第五,用sparse matrix處理大矩陣。
第六,使用正確的演算法也很重
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