染色珍珠的染色方法是用染料滲透到珍珠的裡層，達到染色目的，有機染料是染色金珍珠的致色成分。淡水珠質地較軟，短則幾個小時，長則幾天就可以達到目的。南珠珠質較硬，也僅需2個月左右時間。南洋珠的珠質更緻密，須用強光照射加以輔助，加速染料的滲透和均勻分佈，這就是市面上說的“鐳射染色”、“輻射染色”、“烤色”等稱呼，此法同樣需要1-2個月，而且成本很高，加上染色失敗和外帶經濟和法律上的風險，故此法應用較少。天然金珍珠的主要致色成分是金屬離子、卟啉和類胡蘿蔔素，染色珍珠顏色分佈不均勻，在孔眼內或表面破損處可看到染料的沉澱濃集;紫外可見吸收光譜法是目前較為常用的鑑定方法，天然金珍珠主要吸收峰位於350-360nm，而染色金珍珠則出現明顯的410-450nm譜峰;應用拉曼光譜法鑑定可獲得天然金珍珠在275cm-1明顯的特徵峰，而染色金珍珠出現強的熒光背景峰;應用熒光光譜法鑑定金黃色天然珍珠在376nm處光激發時譜峰是以472nm為中心，而染色珍珠在372nm處受光激發時譜峰位於436nm。
