種子可呈圓形、圓柱形、橢圓、扁圓、凹圓形，每莢2～10顆，多為青綠色，也有黃白、紅、玫瑰、褐、黑等顏色的品種。可根據表皮分為皺皮及圓粒，幹後變為黃色。種子的顏色有紅、黃、綠、黑、白、紫、灰等多種多樣，1公斤芝麻竟有25萬粒之多。但是，就植物的種子來說，比芝麻小的還多著呢。5萬粒芝麻的種子，有200克重，可是5萬粒菸草的種子，只有7克重。四季海棠的種子還要小，5萬粒只有0.25克。一粒小小的芝麻，比一粒四季海棠種子要重近千倍。但是，別以為這是最小的植物種子。有一種植物叫斑葉蘭，它的種子小得簡直象灰塵一樣，5萬粒種子只有0.025克重，1億粒斑葉蘭種子才1兩重。人們至今還沒有發現比這更小的種子。
