工程結算糾紛是哪個部門管

工程結算糾紛的處理，以預算部為主，其它部門配合完成。國務院以及縣級以上地方人民政府住房城鄉建設主管部門負責。

【法律依據】

根據《建築工程施工發包與承包計價管理辦法》第4條規定，國務院住房城鄉建設主管部門負責全國工程發承包計價工作的管理。

縣級以上地方人民政府住房城鄉建設主管部門負責本行政區域內工程發承包計價工作的管理。其具體工作可以委託工程造價管理機構負責。