明代的兩京制既有歷史繼承性，也有其建國初期的特殊原因遺留。
從周朝開始，兩京和多京一直是國家建都的重要原則，即在京師之外再設陪都。但如明朝“以金陵開基，金臺定鼎（指北京）”的現象，歷史上並不多見。明代在南京另設中央技工的事實，更為歷史僅見。永樂癸未北遷之後，南都成為留都，雖然之後幾十年遷都問題一直在爭論。但此後南都政府班子的功用已發生變化，大致成為了以下幾類官員的聚集地：
1、受政治排擠失意者或求“悠閒”者；
2、官員養家養病請改任者；
3、將南京職官作為一個“相與講求民謨，料理天下利害”，以備“異日入輔大政”的歷練之所；
4、看重南京官位之榮譽者。
雖然遷都給南京帶來短暫凋敝，但很快南都重新就復甦為全國繁華的都市文化中心，南京留都地位也一直保留下去。
