非法運營車輛處罰標準為：有違法所得超過２萬元的，沒收違法所得，處違法所得２倍以上１０倍以下的罰款；沒有違法所得或者違法所得不足２萬元的，處３萬元以上１０萬元以下的罰款；構成犯罪的，依法追究刑事責任。
根據我國《運輸管理條例》第六十四條規定，違反本條例的規定，未取得道路運輸經營許可，擅自從事道路運輸經營的，由縣級以上道路運輸管理機構責令停止經營；有違法所得的，沒收違法所得，處違法所得２倍以上１０倍以下的罰款；沒有違法所得或者違法所得不足２萬元的，處３萬元以上１０萬元以下的罰款；構成犯罪的，依法追究刑事責任。
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法律依據：
《中華人民共和國道路運輸條例》第六十四條
違反本條例的規定，未取得道路運輸經營許可，擅自從事道路運輸經營的，由縣級以上道路運輸管理機構責令停止經營；有違法所得的，沒收違法所得，處違法所得2倍以上10倍以下的罰款；沒有違法所得或者違法所得不足2萬元的，處3萬元以上10萬元以下的罰款；構成犯罪的，依法追究刑事責任。
