林正英去世是因為患上了肝癌，林正英在拍戲過程中經常風餐露宿，而且壓力非常大，熬夜工作是常有的事，長期下去他的身體本來就吃不消，再加上林正英本人又比較喜歡小酌幾杯，如此下來他的身體出現異樣，最終在1997年11月8日因肝癌去世，年僅45歲。
其實在1997年開頭林正英的身體就已經出現不適，但是他熱衷於拍電影，就在自己病情加重到咳血的時候他依然要堅持拍戲，在鏡頭前表現出很精神的一面，後來知道自己被檢查出患上晚期肝癌時，他主動向女友苑瓊丹提出分手不願意耽誤她的人生。
林正英的師兄弟們和洪金寶在得知他的病情後都想要去醫院探望，但林正英感覺生病的樣子實在太難看，他想把美好有精氣神的一面留給大家，拒絕別人的探望，就連自己的兒女他也不見，在1997年11月8日林正英最終還是因為肝癌晚期去世，年僅45歲，他的葬禮用的是佛教儀式。
