1、性質不同：系統還原是恢復電腦出廠系統或設定。系統重灌是使用一些系統安裝盤重新安裝系統。
2、個人檔案不同：系統還原可以自行選擇是否保留個人檔案。系統重灌不可以自行選擇是否保留個人檔案。
3、保留內容不同：系統還原是保留部分基礎軟體和驅動程式。系統重灌是不保留部分基礎軟體和驅動程式，需要重新安裝。
系統還原：系統還原的目的是在不需要重新安裝作業系統，也不會破壞資料檔案的前提下使系統回到工作狀態。系統還原在Windows Me就加入了此功能，並且一直在WindowsMe以上的作業系統中使用。系統還原可以恢復登錄檔、本地配置檔案、COM+ 資料庫、Windows 檔案保護（WFP）高速快取（）、Windows 管理工具（WMI）資料庫、Microsoft IIS 元資料，以及實用程式預設複製到還原存檔中的檔案。您不能指定要還原的內容：要麼都還原，要麼都不還原。
