1、水分和熱量：高溫多雨，水熱條件優越的地區，生物種類豐富。
2、自然環境複雜：氣候複雜的地區，生物種類豐富；水域環境複雜，水生生物豐富；地形複雜，起伏大的地區，生物種類豐富。
3、環境變遷與突發事件：如地質時期的冰期導致多樣性減少；隕石撞擊地球導致恐龍滅絕；全球變暖，臭氧層破壞導致生物多樣性減少；環境變化導致食物缺乏等。
4、天敵與外來物種的干擾：最主要原因是人類的濫捕濫獵、人類的生產和活動及汙染排放破壞生態環境（如食物鏈的破壞、對動物棲息地的破壞、動物食用被汙染的食物等），導致生物多樣性減少。
