1、蝦虎魚的特點是身體細長，體型小，大多數短於10cm。有兩條脊鰭。第一條有幾根細微的脊骨，頭部和兩側有一系列小的感覺器官，尾巴呈圓形，身上都有明亮的色彩。有些種類，如歐洲的水晶蝦虎魚呈現透明的色彩。
2、蝦虎魚類突出的形態特徵就是其腹鰭癒合成一吸盤狀。該吸盤的功能與？魚的背鰭吸盤和圓鰭魚科的腹鰭吸盤類似，但在解剖上是十分不同的結構，因此只是趨同進化的結果。
3、世界上最小的脊椎動物要數Trimmatom和Pandaka屬的蝦虎魚類，它們完全成熟後也短於1cm ，分佈在菲律賓的一種蝦虎魚身長只有13毫米。也有些體型較大的蝦虎魚，比如擬蝦虎魚Gobioides的種類，體長可超過30cm，但這是少有的例外。
