黴菌的菌絲分為兩類，即無隔膜菌絲和有隔膜菌絲。在固體培養基上，營養菌絲是伸入培養基內吸收營養成分的部分菌絲；生長向空氣中的菌絲為氣生菌絲、而氣生菌絲髮育到一定階段，將會成為繁殖菌絲。黴菌的細胞壁的主要成分為多糖，低等黴菌為纖維素，高等黴菌為幾丁質。這種區別可以用於黴菌的分類鑑定，細胞壁組分的分析是鑑定最重要的依據之一。黴菌的細胞壁可以被蝸牛酶消化，獲得原生質體。
黴菌：繁殖能力很強，繁殖方式多種多樣，能進行無性繁殖和有性繁殖。一般是先進性無性繁殖，後進行有性繁殖。其氣生菌絲可以特化成各種形態的子實體，如擔孢子。黴菌在生活中也可造成危害，如生長在食品、糧食、果蔬上，造成食物黴變。其中危害最大的是黃麴黴，其產生的黃麴黴毒素毒性極大。
