半自主複製說的半自主不是隻DNA分子，而且只線粒體或葉綠體的整體結構是半自主的。線粒體或葉綠體有自己的DNA，有自己的核糖體，可以自己合成蛋白質，但是這些蛋白質只是線粒體或葉綠體所有蛋白質的一部分，需要細胞核基因的轉錄翻譯提供的其他蛋白質，所有線粒體或葉綠體是半自主複製。
線粒體是一種存在於大多數細胞中的由兩層膜包被的細胞器，是細胞中製造能量的結構，是細胞進行有氧呼吸的主要場所。其直徑在零點五到一微米左右。
葉綠體是植物細胞內最重要、最普遍的質體，它是進行光合作用的細胞器。葉綠體利用其葉綠素將光能轉變為化學能，把二氧化碳與水轉變為糖。
