常見的併發症有以下幾種：
腹瀉：是最常見的併發症，發生率可高達百分之六十二。通常發生於鼻飼開始使用高滲性飲食，胃腸道分泌大量水以稀釋溶液的濃度，腸道蠕動加速，易產生腹瀉。噁心嘔吐：鼻飼輸注的速度過快與量過大易引起噁心、嘔吐，可減慢輸注速度，液量以遞增的方式輸入。高血糖與低血糖：高糖血癥與大量鼻飼高滲糖飲食有關，由於過分強調營養補充，使其配方中呈高糖成分。低糖血癥多發生於長期鼻飼飲食而突然停止者。脫水：可由腹瀉、尿糖或者攝水不足引起，護理中應逐漸增加飲食的濃度與量，並經常監測電解質變化及尿素氮的水平。誤吸：是較嚴重的併發症之一，衰弱、年老或昏迷的病人，有食道返流者尤易發生液體飲食返流，吸入氣管。胃瀦留：病人因為胃腸蠕動慢，並有輸入的營養液瀦留於胃腸內造成。需延長輸注間隔，促進胃排空。
