細菌主要由細胞壁、細胞膜、細胞質、核質體等部分構成，有的細菌還有莢膜、鞭毛、菌毛、纖毛等特殊結構。細菌結構沒有葉綠體，也沒有線粒體，大部分不能進行光合作用。部分細菌（如藍藻）細胞膜上擁有葉綠素，可進行光合作用。
構成細菌主要由細胞壁、細胞膜、細胞質、核質體等部分構成。
1、細胞壁
細胞壁包被於細菌細胞最外層，是具有堅韌性和彈性的複雜結構。
2、細胞膜
細胞膜是位於細胞壁內側，緊包在細胞質外面，是一層具有半滲透性的生物膜。
3、細胞質
其基本成分是水、蛋白質、脂類、核酸及少量糖和無機鹽等。胞質核心糖核酸含量高，易被鹼性染料著色。細胞質是細菌蛋白質和酶類合成的重要場所。
4、核質體
細菌的核質是由一條雙股環狀的DNA分子組成，無核膜、核仁，與細胞質界限不明顯，DNA分子反覆迴旋盤繞成超螺旋結構，控制細菌的各種遺傳性狀，亦稱為細菌染色體。
