負數發票即稅務管理系統中的紅字發票，因為發票開具錯誤、交易取消、銷售貨物退回等原因，需要更換正確發票或退回發票，但發票不符合退回作廢條件的，需要開具紅字發票，沖銷原藍字發票，重新開具正確發票。
購貨方已認證且通過並申報抵扣的：由購貨方或勞務接收方向主管稅務機關填寫申請，在開票系統中直接填寫《開具增值稅紅字專用發票資訊表》，已經抵扣的，手工填寫銷售方名稱、稅號等資訊，無需填寫相應藍字發票程式碼、發票號碼等資訊，確定無誤後點擊儲存；B、認證結果為“納稅人識別號認證不符”、“專用發票程式碼、號碼認證不符”的，填寫《開具增值稅紅字發票資訊表》時，需填寫相對應的藍字專用發票程式碼、發標號碼資訊，然後選擇相應的開具紅字發票理由。儲存之後選擇“上傳”，軟體上傳資訊表到稅務局伺服器，收到稅務機關網上稽核通過的資訊表，據以開具紅字發票；也可以儲存之後，選“擇導”出文件，拷貝電子檔案到U盤上，並列印紙質申請表，一併帶到主管稅務機關申請紅字發票通知單，將《開具紅字發票通知單》交給銷貨方，銷貨方憑稅務局稽核通過並加蓋公章的《開具紅字發票通知單》開具紅字發票。
