糞便的四分之一是水分，其餘大多是蛋白質、無機物、脂肪、未消化的食物纖維、脫了水的消化液殘餘、以及從腸道脫落的細胞和死掉的細菌，還有維生素K、維生素B。對於農民來說，糞便可以作為較好的莊稼的有機肥料。
食物在胃和腸道內進行消化、主要是各種消化酶的作用。結腸不產生酶，只有細菌起消化作用。結腸內有多種細菌，大腸桿菌70%，厭氧桿菌20%，還有鏈球菌、變形桿菌、葡萄球菌、乳桿菌、芽胞和酵母。另有極少原生動物和螺旋體。腸細菌的重要作用是能產生生理需要的物質，如食物缺乏維生素時可在腸內合成維生素K、維生素B1、B2、維生素H、維生素B12、B6、蔚酸，葉酸和消旋泛酸。
