兩者區別主要有以下幾點：
1、適用法律不同，個人獨資企業依照《個人獨資企業法》設立，個體工商戶按照《個體工商戶條例》等規定設立;
2、個人獨資企業只能由個人出資設立，而個體工商戶既可以由一個自然人設立，也可以由家庭出資設立;
3、個人獨資企業投資人以其個人財產對企業債務承擔無限責任，只有在企業設立登記時明確以家庭共有財產作為個人出資的，才依法以家庭共有財產對企業債務承擔無限責任;而個體工商戶的債務如屬個人經營的，以個人財產承擔，如屬家庭經營的，以家庭財產承擔;
4、個人獨資企業是經營實體，是一種企業形態，個體工商戶不採用企業形式。一般認為屬於“個人”。
法律依據：
《中華人民共和國個人獨資企業法》第二條，本法所稱個人獨資企業，是指依照本法在中國境內設立，由一個自然人投資，財產為投資人個人所有，投資人以其個人財產對企業債務承擔無限責任的經營實體。
