影響細胞呼吸的因素有：內因和外因。內因是由遺傳決定酶活性，同一生物不同生長髮育時期呼吸速率不同，同一生物不同器官呼吸速率不同，不同生物呼吸速率不同。
外因有：
溫度，細胞呼吸是由酶催化的一系列反應過程，因此細胞呼吸對溫度的變化很敏感。在一定範圍內，細胞呼吸隨溫度的升高而加快，但超過最適溫度後，細胞呼吸將急劇減弱，直至停止。
氧氣濃度，氧氣促進需氧呼吸，抑制厭氧呼吸，在一定範圍內呼吸強度隨著氧氣濃度升高而增大。
二氧化碳濃度，增加二氧化碳濃度對有氧呼吸有抑制作用。
水，在一定範圍內細胞呼吸強度隨含水量的升高而加強，隨水量的減少而減弱。
