那曲蟲草和青海蟲草的區別在於蟲體顏色，西藏的那曲蟲草，蟲體的顏色是棕黃色，主要以黃色為主，色澤比較亮，蟲體的眼睛主要是棕色。青海的玉樹蟲草，蟲體的顏色也是棕黃色，但顏色比那曲的要略深，顯得有點黑，沒有那麼亮，感覺表面上像有層灰一樣。玉樹產的蟲草，蟲體的眼睛一般是黃色。
西藏的那曲蟲草，由於溫度更適宜蝙蝠蛾幼蟲生長，所以一般的那曲蟲草個頭都比較大，顯得蟲體比較肥，但重量與相同大小的玉樹蟲草比較，略輕一點。同樣重量的玉樹和那曲蟲草，玉樹的個體相對於那曲蟲草略小一點，但它更緊實更僵硬，那曲的相對來說更膨鬆。
