奧迪a6共有三個空調濾芯，分別位於副駕駛座扶手箱、進氣歧管、發動機艙導水槽蓋板下方。
空調濾清器是一種專門用於奧迪A6車廂內空氣淨化的過濾器。採用高效吸附材料-活性炭與長絲無紡布覆合的活性炭複合濾布；結構緊湊，能有效過濾煙臭、花粉、塵埃、有害氣體和各種異味。濾清器還能高效過濾吸附顆粒雜質達到濾油、淨化空氣效能的同時，又能很好的去除TVOC、苯、酚、氨、甲醛、二甲苯、苯乙稀等。
A6共有三個濾芯，一個是空氣濾芯，一個花粉濾芯，一個粉塵濾芯。花粉過濾器是一種空氣淨化器。分室內用和車用。室內用花粉過濾器可有效過濾蒿草、葎、豚草、圓栢等多種致敏花粉。車用主要適用於各類中、高檔轎車、豪華客車的空調送風迴圈系統，以實現車內空氣環境的淨化目的。它能有效阻止各類汙染物及汽車排放的廢氣進入車廂內。特殊的花粉過濾器還可採用活性炭技術實現車體內有害化學物的空氣汙染控制。
