工程款稅率是多少要分不同情況來確定：
1、一般納稅人
國稅方面要按增值額交11%的增值稅。地稅方面：按增值稅額的5%交納城建稅；按增值稅額的3%交納教育附加；按增值稅額的2%交納地方教育附加；按利潤交25%的企業所得稅。
2、小規模納稅人
國稅方面要按營業額交3%的增值稅，營業額如果不超過30000元就不需要交稅。地稅方面：按增值稅額的5%交納城建稅；按增值稅額的3%交納教育附加；按增值稅額的2%交納地方教育附加，按利潤交25%的企業所得稅。
3、個體工商戶
營業額如果不超過30000元就不需要交稅，超過的按小規模納稅人規定交稅。
