1、細菌侵染，如青枯病。該病多從枝條頂端葉片開始萎蔫，伴隨整株葉片同時萎蔫青枯，病程較短。病莖外表症狀不明顯，縱剖莖部維管束變為褐色，橫切面保溼可見乳白色粘液溢位。
2、為真菌病害，主要有枯萎病、疫病和菌核病3種。枯萎病發病初期下部葉片大量脫落，與地面接觸的莖基部皮層呈水漬狀腐爛，地上部莖葉迅速凋萎。疫病在辣椒整個生育期均可發生，以坐果後最易受害。成株期受害時，病部形成長條形斑，病健交界處明顯，病斑凹陷或稍縊縮，病株葉片萎蔫脫葉致死亡。菌核病為害莖部或枝叉處，溼度大時，病部長出白色菌絲體，後期可長出黑色鼠糞狀菌核，最後植株枯死。青枯病和枯萎病發生的比例很小，但青枯病是細菌性病害，不僅傳播快，而且病程短、死得快，經常是毀滅性災害。
