按照新政策的調整，鄉鎮指定醫院，農民花銷100元以上的報銷比例可達到85%，縣級醫院按照400元以上可報銷，比例達到75%，市級醫院需達到1000元以上才可報銷，報銷比例為65%。
1、門診報銷比例：如果是在村衛生室及村中心衛生室就診報銷60%；鎮衛生院就診報銷40%；二級醫院就診報銷30%；三級醫院就診報銷20%。
2、住院報銷比例：鎮衛生院報銷60%；二級醫院報銷40%；三級醫院報銷30%。
3、大病醫療報銷比例：凡參加合作醫療的住院病人一次性或全年累計應報醫療費超過5000元以上分段補償，即5001-10000元補償65%，10001-18000元補償70%。並且只要是在鎮級合作醫療住院及尿毒症門診血透、腫瘤門診放療和化療，每年還可限額補償1.1萬元。
