1、海膽煮不熟含有細菌，海膽中的病菌主要是副溶血性弧菌等，耐熱性比較強，80℃以上才能殺滅。除了水中帶來的細菌之外，海鮮中還可能存在寄生蟲卵以及加工帶來的病菌和病毒汙染。一般來說，在沸水中煮4-5分鐘才算徹底殺菌。
2、在海膽中有兩種產生毒素的器官：叉棘和棘，在生殖季節攝食海膽的生殖腺和卵巢或被棘或叉棘鰲刺會引起中毒。已報道過的白棘三列海膽、球海膽、毒海膽、石筆海膽等數十種海膽都是有毒的。海膽毒素的作用各不相同，有的對動物可引起呼吸困難、肌肉麻痺、抽搐以至死亡；有的對動物紅細胞有溶解作用，並能引起心臟的啟用和使肌肉對非直接性刺激不起反應，具有潛在的藥用價值。
