光合作用與呼吸作用的區別部位不同，光合作用進行的部分必須有葉綠體的細胞，因為葉綠體是進行光合作用的結構基礎，形象地比喻為製造有機物的“機器”。呼吸作用所有的活細胞都要進行，細胞活著就要進行正常的生命活動，而生命活動需要能量支援才能正常完成，而這個能量是由呼吸作用分解有機物釋放得來的，沒有呼吸作用，細胞就不能正常生活，就會死亡。
呼吸作用與光合作用是相互依存的關係。如果沒有光合作用製造的有機物，呼吸作用就無法正常進行。這是因為呼吸作用所分解的有機物正是光合作用的產物，呼吸作用所釋放的能量正是光合作用儲存在自機物中的能量。
如果沒有呼吸作用，光合作用也無法正常進行。這是因為植物進行光合作用的時候，原料的吸收和產物的運輸所需要的能量，正是呼吸作用釋放出來的。
