因為頂芽優勢並不完全依賴於生長素，如營養、光照等都有作用，更重要的是一種激素，即細胞分裂素也對頂芽優勢起著重要作用。細胞分裂素還參與頂芽優勢產生。生長素都從頂芽向下運輸的，根部合成的細胞分裂素是從根部向上運輸的，生長素和細胞分裂素在這裡的作用是相反的。生長素抑制側芽的發育，但是距地面近的側芽在生長素還沒有到達時首先收到了大量來自根部的細胞分裂素，因而分裂發育起來，而一旦開始發育，生長素即使到來也不再生效了。在這兩種激素的相反的作用之下，植株靠下面的側枝可以發育得很好，越往上，細胞分裂素越少，生長素越多，側枝就越小，結果支柱發育成底寬上尖的寶塔形。
