生奶因為沒有經過消毒處理，而且沒法確保奶牛本身是否健康，容器、用具等是否衛生，以及運輸過程中是否受到汙染等，因而很容易受到來源於環境中的大腸桿菌、金黃色葡萄球菌、假單胞菌、真菌等，以及源於動物體的布魯氏桿菌、結核桿菌等人畜共患致病菌等的汙染。
例如，喝了被布魯氏菌汙染的生奶，有可能患布魯氏菌病，該病可引起持續發熱、多汗、關節痛及肝脾腫大等，當進入慢性期，可能引發多器官和系統損害。所以不建議直接喝生奶，特別是對於兒童、老人、孕婦和免疫力低下的人來說，受到這些病菌感染的危險更大。目前國內外均有因為喝生奶而引起中毒的報道。
因此，生奶一定要經過充分的加熱煮沸（至少5分鐘）後才可以喝。當然，最保險的做法是，直接到超市裡購買低溫奶、常溫奶等經過消毒滅菌處理的奶。
