完整的鮮檸檬在5~8度環境下，一般可以存放6~8個月。如果切開後一次吃不完的檸檬，可以切片放在蜂蜜中醃漬，日後拿出來泡水喝。同時也可切片放在冰糖或白糖中醃漬，也可用來泡水喝。不過兩種都要保證不要帶水，否則有可能會爛掉。
因為榨好一次用不完的檸檬汁我們可以把口封緊放入冰箱中儲存，而且時間限制在3天之內，如果時間長了會造成維生素C揮發。
但是如果想儲存更久些，最好是將檸檬做成檸檬蜜;切片後放入乾燥玻璃容器中，加入蜂蜜直至完全沒過檸檬片，密封后放入冰箱裡儲存。因為這種蜜能較長期儲存，可以儲存一個月。切記儲存過程中不能接觸油脂和水。
