市直機關工會和市總工會的區別是性質不同，市直機關工會是基於共同利益而自發組織的社會團體。總工會是中國共產黨領導的職工自願結合的工人階級群眾組織，由中國共產黨中央委員會書記處領導。五四運動時期，隨著馬克思主義在中國的傳播，工人階級作為一支獨立的政治力量開始登上歷史舞臺。
中國無產階級工會是隨著中國工人運動的發展而逐步形成的。1920年8月，陳獨秀在《勞動界》發表的《真的工人團體》中呼籲工人聯合起來。隨著各地工人運動的發展，上海、廣東等地的共產主義團體相繼建立了一些階級性、群眾性、民主性鮮明的現代工會組織。
