郵件伺服器使用的協議有三種，分別是SMTP協議、POP協議、IMAP4協議。
1、SMTP協議：SMTP協議的作用是把郵件訊息從發信人的郵件伺服器傳送到收信人的郵件伺服器。SMTP的歷史比HTTP早，RFC是在1982年編寫的。
2、POP協議：經常使用電子郵件處理公務的人群會常用到POP協議，POP適用於C/S結構的離線模型的電子郵件協議。
3、IMAP4協議：IMAP4協議與POP3協議一樣也是規定個人計算機如何訪問網上的郵件的伺服器進行收發郵件的協議，但是IMAP4協議同POP3協議相比更高階。IMAP4支援協議客戶機線上或者離開訪問並閱讀伺服器上的郵件，還能互動式的操作伺服器上的郵件。
