目前世界上細菌已知種樹為4760種，估計細菌種樹為40000種。細菌按其外形分為三類：球菌、桿菌、螺形菌。球菌，呈圓球形或近似圓球形，有的呈矛頭狀或腎狀。單個球菌的直徑約在0.8～1.2um左右。桿菌，各種桿菌的大小、長短、彎度、粗細差異較大。大多數桿菌中等大小長2～5um，寬0.3～1um。大的桿菌如炭疽桿菌(3～5um×1.0～1.3um),小的如野兔熱桿菌(0.3～0.7um×0.2um)。菌體的形態多數呈直杆狀，也有的菌體微彎。菌體兩端多呈鈍圓形，少數兩端平齊如炭疽桿菌，也有兩端尖細如梭桿菌或未端膨大呈棒狀如白喉桿菌。排列一般分散存在，無一定排列形式，偶有成對或鏈狀，個別呈特殊的排列如柵欄狀或V、Y、L字樣！
