1、化學消毒劑的作用原理破化蛋白質，使病原體蛋的白質變性。
2、化學消毒劑的作用機制是，改變細胞膜通透性表面活性劑（Surface-activeagent）、酚類及醇類可導致胞漿膜結構紊亂並干擾其正常功能。使小分子代謝物質溢位胞外，影響細胞傳遞活性和能量代謝。甚至引起細胞破裂。
3、蛋白變性或凝固酸、鹼和醇類等有機溶劑可改變蛋白構型而攏亂多肽鏈的摺疊方式，造成蛋白變性。如乙醇、大多數重金屬鹽、氧化劑、醛類、染料和酸鹼等。
4、改變蛋白與核酸功能基團的因子作用於細菌胞內酶的功能基（如SH基）而改變或抑制其活性。如某些氧化劑和重金屬鹽類能與細菌的-SH基結合並使之失去活性。
