1、紅檀木橫斷面：心邊材區別明顯。心材紅褐色，常具深色同心圓狀條紋。邊材淺黃色，具不規則黑條紋。生長輪略可見。
2、紅檀木觀構造：散孔材。管孔放大鏡下明顯，略少，中等大小；主為單管孔，少數徑列復管孔；具淺黃色樹膠白色沉積物。軸向薄壁組織肉眼下明顯，發達，傍管帶狀，間距小，波浪形，木射線放大鏡下可見，略密，甚窄。
3、小葉紫檀有特殊的香味，對人體是非常有益的，顏色深、硬度大、油性強，是散孔材，生長輪不明顯，心材新切面桔紅偏黃，幾日後轉為富貴紅久則轉為深紫或黑紫，其紋理明顯且富有變化，有淺色和紫黑色條紋，黑色素不規則釋出。
4、小葉紫檀會掉色，在古代，小葉紫檀甚至被用來做過染料，在小葉紫檀的表面可以看到牛毛紋，牛毛紋不過是由於紫檀紋理交錯捲曲而形成的，是比較稀少的。
