南書房：是清代皇帝文學侍從值班之所，皇帝每外出巡幸亦隨扈。皇帝即興作詩﹑發表議論等場所。進而常代皇帝撰擬詔令諭旨，參預機務。
軍機處：是清朝官署名，也稱軍機房、總理處。是清朝時期的中樞權力機關，乾隆帝時期復設軍機處，從此成為清朝的中樞權力機關，一直到清末。
區別：南書房設立於康熙朝，原只是康熙讀書的地方，後演變為擬召，諭旨，處理軍國大事的地方。待雍正朝成立軍機處後，實權更歸軍機處，至光緒年間撤銷；軍機處成立於雍正朝，設在靠近養心殿處，方便皇帝及時瞭解軍國大事，後演變成清廷最高權力機構，軍機大臣更成為了帝國的當權者。
