大明宮的毀滅並不是由於自然和地質環境而造成的，而是人為的故意損毀，從大明宮挖掘的遺蹟來看，有明顯的火燒痕跡。要證明現場有沒有經歷過火燒，就要看磚瓦的顏色，如果是被火燒過，殘留下的磚瓦就是紅色或者黑色的焦痕。大明宮的火燒範圍很廣，說明這裡曾經經歷過一場大面積的燒殺。
到了唐朝晚期，由於政治的腐敗，宮廷的鬥爭，使得民不聊生，大唐江山已經搖搖欲墜，就在這時，一支由黃巢帶領的農民起義軍踏入了長安城，踏進了這個曾經只有君王將相才能進入的皇家禁地——大明宮。隨著起義戰爭的打響，大明宮就變成了硝煙瀰漫的戰場，這場起義一把大火點燃了大明宮，這就是發現遺址中為什麼有火燒的痕跡。雖然這場戰爭帶給大明宮的是一場巨大的劫難，但是研究發現，導致大明宮的消失毀滅並不只是這一場劫難，而是經過多次的浩劫。因為發現大明宮裡到處有地磚被撬，石像被搬走的歷史遺蹟。
