基因突變是基因組DNA分子發生的突然的、可遺傳的變異現象。
從分子水平上看，基因突變是指基因在結構上發生鹼基對組成或排列順序的改變。基因雖然十分穩定，能在細胞分裂時精確地複製自己，但這種穩定性是相對的。在一定的條件下基因也可以從原來的存在形式突然改變成另一種新的存在形式，就是在一個位點上，突然出現了一個新基因，代替了原有基因，這個基因叫做突變基因。於是後代的表現中也就突然地出現祖先從未有的新性狀。基因突變可以發生在發育的任何時期，通常發生在DNA複製時期，即細胞分裂間期，包括有絲分裂間期和減數分裂間期。
