1、體長區別。鯉魚體稍大，一般體長30-40釐米，左右兩側扁，腹部圓，背部在背鰭前稍隆起，口呈馬蹄形，有吻須和頜須各1對，後者比前者長一倍，鰓把短，有咽頭齒。而鯽魚一般體長15-20釐米，體側扁，背部隆起，高而寬，腹部圓，頭短而小，吻圓鈍，沒有吻須和頜須，鰓耙細密，有咽頭齒，鱗片大，有十分明顯的側線。
2、魚鰭區別。鯉魚的鱗片大而圓，有胸鰭、腹鰭各一對，背鰭、臂鰭各1個，尾鰭叉形，背鰭、臂鰭均有硬刺，最後一刺的後緣有鉛齒。同鯉魚一樣，鯽魚也有一對胸鰭和一對腹鰭，一個背鰭和一個臂鰭，尾鰭叉形，背鰭和臂鰭也有硬刺，最後一刺的後緣有鋸齒。
3、體色區別。鯉魚體背面為灰黑色，側線下方近青黃色（有的是黑色），腹面為白色，背鰭微黑。而鯽魚的背面是青褐色，腹面為銀灰色，各鰭條均為灰白色，但因生長的水域不同，其體色也有差異。
