小綠毛龜以龜糧為主食，平時需要儘量多補充蛋白質，因此可以餵食蚯蚓、麵包蟲、小魚蝦、紅蟲、果蔬等，但是儘量不要餵食太多，以免小綠毛龜挑食，平時不能餵食肥肉，最好能餵食活體食物，保持飲食多樣才能讓小綠毛龜長得快。
小綠毛龜吃的食物綠毛龜食量很大，但是小綠毛龜儘量不要餵食太多，基本上以餵食龜糧為主，然後適當的餵食些葷食，例如蚯蚓、麵包蟲、小魚蝦、紅蟲等，不能單一餵食一種食物。
平時為了維持綠毛龜體內營養均衡，最好適當的餵食些新鮮的果蔬，也能防止小綠毛龜出現營養不良導致綠毛褪色的現象，但儘量不要過多餵食，以免小綠毛龜挑食。
若是餵食肉類，例如雞肉、牛肉、豬肉等，需要注意不能餵食肥肉，必須要餵食瘦肉，並且在餵食活食的時候最好能餵食活體食物，才能是其中的高蛋白被小綠毛龜吸收。
