微生物營養型別根據微生物需要的主要營養元素即能源和碳源的不同而劃分的微生物型別。分為光能自養型、光能異養型、化能自養型和化能異養型四種。
1、光能自養型：屬於這一類的微生物都含有光合色素，能以光作為能源，二氧化碳作為碳源。如藍細菌、紅硫細菌和綠硫細菌等少數微生物能利用光能從二氧化碳合成細胞所需的有機物質。
2、光能異養型：以二氧化碳為主要碳源或唯一碳源，以有機物作為供氫體，利用光能將二氧化碳還原成細胞物質。
3、化能自養型：以二氧化碳或碳酸鹽作為唯一或主要碳源，以無機物氧化釋放的化學能為能源,，利用電子供體使二氧化碳還原成細胞物質。
4、化能異養型：大部分細菌以這種營養型別生活和生長，利用有機物作為生長需要的碳源和能源。腐生型微生物指利用無生命活性的有機物作為生長的碳源。寄生型微生物指寄生在生活的細胞內，從寄生體內獲得生長所需要的營養物質。
