在無酶催化的情況下，底物需要越過一個較高的活化能才能發生反應，變成產物，酶作為催化劑所起的作用就是降低活化能，從而使反應速度加快，從底物角度來說，當底物進入酶活性中心區域得到集中、濃縮後，由於酶與底物的相互作用，致使兩者的構象都發生了變化，此時底物分子內某些基團電子密度發生了變化，形成所謂電子張力，使與之相連的敏感鍵一端變得更加敏感，更易斷裂，穩定的酶與底物共價中間物，此中間物很容易變成過渡態，使反應活化能大為降低，這樣底物就可以越過較低活化能屏障形成產物，同時酶和底物的相互作用時要釋放一些結合能，以使酶與底物複合物穩定，同時可用來降低化學反應所需的活化能了。
