苯扎氯銨對寶寶有害。因為嬰兒的面板是比較嬌嫩的，苯扎氯銨容易使嬰兒的面板受到損傷，在臨床上主要用於術前對面板的消毒，用法是比較固定的。藥物在應用過程中會產生一些不良反應，可能引起過敏等，容易導致患者出現嘔吐冷汗，胃腸道症狀等反應。
苯扎氯銨為陽離子表面活性劑，系廣譜殺菌劑，能改變細菌胞漿膜通透性，使菌體胞漿物質外滲，阻礙其代謝而起殺滅作用。對革蘭陽性細菌作用較強，對綠膿桿菌、抗酸桿菌和細胞芽胞無效。能與蛋白質迅速結合，遇有血、棉花、纖維素和有機物存在，作用顯著降低。0.1%以下濃度對面板無刺激性。
