1、外形上的區別:小番茄果形一般呈現橢圓形或者方圓形，而聖女果在外形上就比較多樣，有球形、洋梨形、醋粟形；
2、營養價值上的區別:雖然聖女果和小番茄的營養成分基本相同，但是就營養價值而言，聖女果要高於小番茄。維生素含量聖女果是小番茄的1.8倍，聖女果中維生素的含量更是果蔬之首。另外，聖女果中含有的特殊物質谷胱甘肽可以促進人體的生長髮育，尤其是對於小孩的發育有益；
3、口感上的區別:口感上聖女果的甜度要比小番茄高；
4、顏色上的區別:聖女果顏色要比小番茄豐富得多，成熟的小番茄一般是紅色的，而聖女果一般有紅色、黃色、粉色、橙色。
