河豚肚皮上才長有沙刺，帶刺的肚皮一般都不吃，連皮帶刺一塊割掉，其他地方的皮僅可食用。食用河豚外皮時將外皮翻過來卷著食用，這樣才能避免被河豚尖刺刺傷。河豚魚的魚皮中含有大量的膠原蛋白，營養豐富。
河魨肌肉潔白如霜，肉味腴美，鮮嫩可口，含蛋白質甚高，營養豐富。唯肝臟、生殖腺及血液含有毒素，經處理後，始可食用。醃製後俗稱“烏狼鯗”。卵巢可提製河豚毒素結晶，供醫藥用。河魨魚體內富含DHA、EPA和人體必需且不能自行合成的八種“氨基酸”及多種微量元素。具有抗癌、抗衰老作用的硒、鋅等元素的含量高於甲魚和海蔘。安全食用河魨，具有增強人體免疫力、補腦健腦、提高視力、抑制腫瘤等作用。此外河魨魚還有健胃養胃功效。亞洲的日本、朝鮮及中國均極喜愛吃河魨；凡品嚐過的人都讚美道：“不吃河魨，不知魚味。”食用河魨肉，除品嚐其鮮美外，還有降低血壓，治腰腿痠軟，恢復精力等功能。食用河魨，首先要使肌肉保持新鮮，加工處理要極為嚴格。方法是沿脊骨剖開魚體，將面板撕下，砍掉頭，挖去內臟，將魚肉在清水中反覆洗滌，徹底清除血液方可食用。
